1) 학생 건강증진·학교보건 및 학교급식에 관한 기본정책의 수립 조정에 관한 업무
2) 학생 건강검사 실태조사 및 제도 개선에 관한 업무
3) 학생비만 및 약물 오·남용 예방 대책의 수립·시행에 관한 업무
4) 학교 감염병 및 학생 만성질환 예방에 관한 사항
5) 건강증진학교 제도의 수립·시행 및 운영 지원에 관한 업무
6) 학생자살예방 대책의 수립·시행에 관한 업무
7) 학생정서·행동특성검사의 관리·지원에 관한 업무
8) 학생 정신보건 관련 연구 지원 업무
9) 학교 보건교육(성교육 포함)에 관한 사항
10) 보건교사 및 영양교사 수급 계획에 관한 사항
11) 학교급식의 영양 및 위생·안전관리 기준에 관한 사항
12) 저소득층 및 농산어촌지역 학교급식비 지원에 관한 업무
13) 어린이 식품안전 보호구역의 운영 지원에 관한 업무
14) 학교 식중독 예방대책의 수립·시행에 관한 업무
15) 학교급식 환경 개선에 관한 사항
16) 학교 환경위생정화구역제도의 운영에 관한 업무
17) 학교 내 환경위생 관리에 관한 사항
18) 교육환경평가제도 및 학습환경보호위원회 제도의 운영에 관한 업무
19) 학교 환경 관련 질환 예방대책의 수립·시행에 관한 업무
20) 학생안전지역에 관한 정책의 수립·시행에 관한 업무
21) 학교급식소 종사자의 안전·보건에 관한 사항
22) 심폐소생 및 응급처지 교육 등 학교 응급의료 관리에 관한 사항 | 
